اهداف مرکز: 

• انجام پژوهش‌های بنیادی اپیدمیولوژیک،مولکولی و بالینی در جهت اصلاح نظام ارائه خدمات بهداشتی درمانی کشور به‌منظور جوابگویی به نیازهای جامعه

• جمع‌آوری، تنظیم و طبقه‌بندی اسناد، مقالات و مدارک مربوطه و انتشار آن‌ها در خصوص بیماری‌های مرتبط با سیستم ایمنی و سرطان

• آموزش نیروی انسانی محقق در زمینه بیماری‌های سیستم ایمنی و سرطان

• همکاری با مراکز تحقیقاتی و اجرائی مربوطه در داخل کشور

• همکاری علمی با مراکز تحقیقاتی و آموزشی سایر کشورها و سازمان‌های بین‌المللی